home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1992 #31 / NN_1992_31.iso / spool / bit / listserv / infogcg / 316 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1992-12-21  |  1.1 KB

  1. Path: sparky!uunet!pipex!bnr.co.uk!uknet!mcsun!news.funet.fi!funic!finsun!harper
  2. From: harper@finsun.csc.fi (Robert Harper)
  3. Newsgroups: bit.listserv.info-gcg
  4. Subject: Primers, fasta
  5. Message-ID: <1992Dec21.092900.19626@nic.funet.fi>
  6. Date: 21 Dec 92 09:29:00 GMT
  7. Sender: usenet@nic.funet.fi
  8. Organization: Centre for Scientific Computing, Finland (CSC)
  9. Lines: 15
  10. Nntp-Posting-Host: finsun.csc.fi
  11.  
  12. Hello!
  13.  
  14. I have some problems concerning GCG. I am planning to make some oligos and
  15. then use them as primers. These primers are degenerated. I would like to
  16. know how to make a FASTA with these nucleotide sequences. Is it possible?
  17. I would like to know how these oligos find certain gene. Is there any
  18. program in GCG to compose primers?
  19. How about using codon preference tables ? Can I find any help there?
  20. And how to use them?
  21.  
  22. Best wishes, Jaana H{m{l{inen
  23.  
  24. % Robert Harper                   %   HARPER@FINFUN   %   HARPER@CSC.FI   %
  25. % Finnish State Computer Centre   %      Bitnet       %     Internet      %
  26. % Tietotie 6, 02101 Espoo Finland % Tel 358 0 4572076 % Fax 358 0 4572302 %
  27.