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/ NetNews Usenet Archive 1992 #31 / NN_1992_31.iso / spool / bit / listserv / infogcg / 315 next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1992-12-21  |  1.4 KB
  1. Path: sparky!uunet!pipex!bnr.co.uk!uknet!mcsun!news.funet.fi!ajk.tele.fi!funic!finsun!harper
  2. From: harper@finsun.csc.fi (Robert Harper)
  3. Newsgroups: bit.listserv.info-gcg
  4. Subject: T-tracking programme.
  5. Message-ID: <1992Dec21.092428.19006@nic.funet.fi>
  6. Date: 21 Dec 92 09:24:28 GMT
  7. Sender: usenet@nic.funet.fi
  8. Organization: Centre for Scientific Computing, Finland (CSC)
  9. Lines: 24
  10. Nntp-Posting-Host: finsun.csc.fi
  11.  
  12.  
  13. I repost the following from bionet.software, as I am not
  14. getting any response there...
  15.  
  16. I am looking for a program, that helps one to identify the
  17. position of a clone in a sequence by running only one
  18. sequencing reaction (so-called T-tracking). Some sources,
  19. like Deininger's review (Anal. Biochem 135(1983)247-263) and
  20. Amersham's sequencing leaflet state that this can be done
  21. by computer, but I haven't so far found any reference to
  22. a program that would do it.
  23.  
  24. Otherwise I use the GCG fragment assebly programs, but
  25. haven't been able to figure out how to map T-tracks
  26. by GCG. Any ideas would be appreciated.
  27.  
  28. Jarmo Niemi   Biochemistry, University of Turku
  29.               SF-20500 Turku
  30.               ++358-21-6335758
  31.               janiemi@finabo.abo.fi
  32.  
  33. % Robert Harper                   %   HARPER@FINFUN   %   HARPER@CSC.FI   %
  34. % Finnish State Computer Centre   %      Bitnet       %     Internet      %
  35. % Tietotie 6, 02101 Espoo Finland % Tel 358 0 4572076 % Fax 358 0 4572302 %
  36.