home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Executor 2.0 / executorv2.0.iso / pc / dos / extra / docs / maillist / text / archive.95 / text3517.txt < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1996-03-31  |  4.0 KB  |  112 lines
  1. To: executor@nacm.com
  2. From: auerbach@cell.biol.ethz.ch (Daniel Auerbach)
  3. Subject: Re: E/D software
  4. Sender: owner-paper@nacm.com
  5. Precedence: bulk
  6.  
  7. >-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE-----
  8. >
  9. >On Fri, 21 Jul 1995, Daniel Auerbach wrote:
  10. >
  11. >> Date: Fri, 21 Jul 1995 13:42:22 +0200
  12. >> From: Daniel Auerbach <auerbach@cell.biol.ethz.ch>
  13. >> To: executor@nacm.com
  14. >> Subject: E/D software
  15. >>
  16. >> I found that all the DNA Star programs run without any troubles under
  17. >> E/D. That's probably not worth much to anyone else since these programs
  18. >> are commercial (and awfully expensive on top !!) but for me this is more
  19. >> than wonderful...
  20. >>
  21. >that's great!
  22. >
  23. >i was thinking of trying to put those on my machine but i decided it
  24. >wasn't worth the trouble as i doubted they would work.
  25.  
  26.  
  27.  
  28. Sorry about the delay in answering, but I've been working the whole weekend
  29. putting sequences together :(
  30.  
  31. First, I apologize for my "all programs work fine" statement. They do work fine,
  32. but there still are some annoying bugs. If ARDI could look into those - I
  33. belive
  34. announcing that executor 2.0 runs DNA Star flawlessly could get you al lot
  35. of licences !
  36. To my knowledge there's no DNA Star version for IBM (BTW, has anyone tried
  37. Current
  38. Contents with executor ? I think this might sell some executor licences, too).
  39.  
  40. Anyway, my problems are mostly with Edit Sequence (Mapdraw and Align seem to
  41. work well). If you open a sequence file, sometimes it appears ok, that is,
  42. the text is
  43. not bold and you can edit the sequence alright. But sometimes, the whole
  44. sequence text
  45. is printed in bold, it doesn't use the whole window when you resize it
  46. (making it bigger)
  47. and above all, the cursor jumps something between one and two bases when
  48. you use the
  49. arrows to move through the sequence. Also, it partly deletes letters while
  50. moving, and if
  51. you use the mouse to position the cursor and then the keyboard to shift it,
  52. you'll have a
  53. "permanent" cursor where you first positioned it. This happens with about
  54. half of all the files
  55. you open. It looks to me as though executor overrides Edit Sequence to
  56. print the sequence on the screen. Maybe a font problem ?
  57.  
  58.  
  59. Sorry for all this blabla but since (I  think) DNA Star is much better than
  60. DNA Strider, you should also take a look at this one (especially since
  61. there don't seem to be many bugs...).
  62.  
  63. Some other things I noticed:
  64.  
  65. If you move a file from one folder to another and both folders are set to
  66. have the files appear as listings, after moving, the new file always
  67. appears as an icon somewhere below the listings of the rest of the files
  68. (which are still as text, though).
  69.  
  70. If you have your files as listings and then make the folder windows real
  71. big, executor shows two
  72. rows of files, even if there are only two files in the folder. However, you
  73. can never choose the one in the second row - you always end up with this
  74. one just simply disappearing!
  75.  
  76. Finally, when I try E/D with -size 800x600 with my Mach32 VLB card, the
  77. refresh rate is
  78. abnormally low - if I try it with a dead cheap OAK VGA card with 512K, it
  79. works fine however.
  80. Am I missing some switch  to put up the refresh rate or am I just being
  81. stupid or something ?
  82.  
  83. I have a 486 DX2/66 with 16 megs RAM and (normally...) a ATI Mach32 card
  84. with 2 megs
  85. VRAM.
  86.  
  87.  
  88. Thanks for reading all that stuff and *please* think about testing DNA
  89. Star. I'd be really
  90. happy to see it running 100%...
  91.  
  92.  
  93.                         - Dan
  94.  
  95. P.S.  Ooops, sorry - yes, it runs not exactly fast, but its enough to work
  96. with it. Actually, I opened 15 sequence files (in Edit Sequence) and still
  97. it didn't slow down. Computing
  98. restriction maps in Map Draw takes a while, though. Try it, it's really
  99. cool (much better
  100. than Strider) !
  101.  
  102.  
  103. ------------------------------------------------------------------
  104. *  Daniel Auerbach, Institute for Cell Biology
  105. *  phone: ++41 1 633 33 93, FAX: ++41 1 633 10 69
  106. *  HPM F 46, CH-8093 Zurich, Switzerland
  107. *  auerbach@cell.biol.ethz.ch
  108. ------------------------------------------------------------------
  109.  
  110.  
  111.  
  112.