home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Executor 2.0 / executorv2.0.iso / pc / dos / extra / docs / maillist / text / archive.95 / text3513.txt < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1996-03-31  |  4.6 KB
  1. Received: from bernina.ethz.ch (bernina-rz-fddi.ethz.ch [129.132.98.11]) by nacm.com (8.6.10/8.6.9) with SMTP id EAA13312 for <executor@nacm.com>; Tue, 25 Jul 1995 04:16:19 -0700
  2. Received: from kontiki (actually kontiki.ethz.ch) by bernina.ethz.ch 
  3.           with SMTP inbound; Tue, 25 Jul 1995 13:16:07 +0200
  4. Date: Tue, 25 Jul 1995 13:11:39 +0200
  5. Received: from [129.132.49.126] by kontiki.ethz.ch id NAA10715;
  6.           Tue, 25 Jul 1995 13:11:39 +0200
  7. X-Sender: auerbach@kontiki.ethz.ch
  8. Message-Id: <v01510101ac3a9f44ac9a@[129.132.49.126]>
  9. Mime-Version: 1.0
  10. Content-Type: text/plain; charset="us-ascii"
  11. To: executor@nacm.com
  12. From: auerbach@cell.biol.ethz.ch (Daniel Auerbach)
  13. Subject: Re: E/D software
  14. Sender: owner-paper@nacm.com
  15. Precedence: bulk
  16.  
  17. >-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE-----
  18. >
  19. >On Fri, 21 Jul 1995, Daniel Auerbach wrote:
  20. >
  21. >> Date: Fri, 21 Jul 1995 13:42:22 +0200
  22. >> From: Daniel Auerbach <auerbach@cell.biol.ethz.ch>
  23. >> To: executor@nacm.com
  24. >> Subject: E/D software
  25. >>
  26. >> I found that all the DNA Star programs run without any troubles under
  27. >> E/D. That's probably not worth much to anyone else since these programs
  28. >> are commercial (and awfully expensive on top !!) but for me this is more
  29. >> than wonderful...
  30. >>
  31. >that's great!
  32. >
  33. >i was thinking of trying to put those on my machine but i decided it
  34. >wasn't worth the trouble as i doubted they would work.
  35.  
  36.  
  37.  
  38. Sorry about the delay in answering, but I've been working the whole weekend
  39. putting sequences together :(
  40.  
  41. First, I apologize for my "all programs work fine" statement. They do work fine,
  42. but there still are some annoying bugs. If ARDI could look into those - I
  43. belive
  44. announcing that executor 2.0 runs DNA Star flawlessly could get you al lot
  45. of licences !
  46. To my knowledge there's no DNA Star version for IBM (BTW, has anyone tried
  47. Current
  48. Contents with executor ? I think this might sell some executor licences, too).
  49.  
  50. Anyway, my problems are mostly with Edit Sequence (Mapdraw and Align seem to
  51. work well). If you open a sequence file, sometimes it appears ok, that is,
  52. the text is
  53. not bold and you can edit the sequence alright. But sometimes, the whole
  54. sequence text
  55. is printed in bold, it doesn't use the whole window when you resize it
  56. (making it bigger)
  57. and above all, the cursor jumps something between one and two bases when
  58. you use the
  59. arrows to move through the sequence. Also, it partly deletes letters while
  60. moving, and if
  61. you use the mouse to position the cursor and then the keyboard to shift it,
  62. you'll have a
  63. "permanent" cursor where you first positioned it. This happens with about
  64. half of all the files
  65. you open. It looks to me as though executor overrides Edit Sequence to
  66. print the sequence on the screen. Maybe a font problem ?
  67.  
  68.  
  69. Sorry for all this blabla but since (I  think) DNA Star is much better than
  70. DNA Strider, you should also take a look at this one (especially since
  71. there don't seem to be many bugs...).
  72.  
  73. Some other things I noticed:
  74.  
  75. If you move a file from one folder to another and both folders are set to
  76. have the files appear as listings, after moving, the new file always
  77. appears as an icon somewhere below the listings of the rest of the files
  78. (which are still as text, though).
  79.  
  80. If you have your files as listings and then make the folder windows real
  81. big, executor shows two
  82. rows of files, even if there are only two files in the folder. However, you
  83. can never choose the one in the second row - you always end up with this
  84. one just simply disappearing!
  85.  
  86. Finally, when I try E/D with -size 800x600 with my Mach32 VLB card, the
  87. refresh rate is
  88. abnormally low - if I try it with a dead cheap OAK VGA card with 512K, it
  89. works fine however.
  90. Am I missing some switch  to put up the refresh rate or am I just being
  91. stupid or something ?
  92.  
  93. I have a 486 DX2/66 with 16 megs RAM and (normally...) a ATI Mach32 card
  94. with 2 megs
  95. VRAM.
  96.  
  97.  
  98. Thanks for reading all that stuff and *please* think about testing DNA
  99. Star. I'd be really
  100. happy to see it running 100%...
  101.  
  102.  
  103.                         - Dan
  104.  
  105. P.S.  Ooops, sorry - yes, it runs not exactly fast, but its enough to work
  106. with it. Actually, I opened 15 sequence files (in Edit Sequence) and still
  107. it didn't slow down. Computing
  108. restriction maps in Map Draw takes a while, though. Try it, it's really
  109. cool (much better
  110. than Strider) !
  111.  
  112.  
  113. ------------------------------------------------------------------
  114. *  Daniel Auerbach, Institute for Cell Biology
  115. *  phone: ++41 1 633 33 93, FAX: ++41 1 633 10 69
  116. *  HPM F 46, CH-8093 Zurich, Switzerland
  117. *  auerbach@cell.biol.ethz.ch
  118. ------------------------------------------------------------------
  119.  
  120.  
  121.  
  122.