home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Liren Large Software Subsidy 13 / 13.iso / p / p260 / 1.ddi / README < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1990-02-09  |  4.5 KB  |  81 lines
  1. /2-Z; Z,1/2-X,1/2-Y; Y,1/2-Z,1/2-X; 
  2. -X,1/2+Z,Y; -Y,1/2+X,Z; -Z,1/2+Y,X;
  3. 1/2-X,Y,1/2-Z; 1/2-Z,X,1/2-Y; 1/2-Y,Z,1/2-X; 
  4. X,1/2-Z,Y; Y,1/2-X,Z; Z,1/2-Y,X;
  5. 1/2-X,1/2-Y,Z; 1/2-Z,1/2-X,Y; 1/2-Y,1/2-Z,X; 
  6. X,Z,1/2-Y; Y,X,1/2-Z; Z,Y,1/2-X;
  7. 999
  8.  223 0 1 PM3N
  9. HHL   0  0  1  2
  10. Z,X,Y; Y,Z,X; 1/2-X,1/2-Z,1/2-Y; 1/2-Y,1/2-X,1/2-Z; 1/2-Z,1/2-Y,1/2-X;
  11. X,-Y,-Z; Z,-X,-Y; Y,-Z,-X; 
  12. 1/2-X,1/2+Z,1/2+Y; 1/2-Y,1/2+X,1/2+Z; 1/2-Z,1/2+Y,1/2+X;
  13. -X,Y,-Z; -Z,X,-Y; -Y,Z,-X; 
  14. 1/2+X,1/2-Z,1/2+Y; 1/2+Y,1/2-X,1/2+Z; 1/2+Z,1/2-Ynd to slow down the dot-matrix output 
  15. slightly.
  16.  
  17. If your system has the proper expanded memory and driver installed, you will 
  18. not see any sign of EM use except as you leave ATOMS.  If there is a problem 
  19. in accessing the memory, you should get one or more error messages on start-
  20. up.  ATOMS does not release the 128K of expanded memory until you are ready to 
  21. exit the program, so that if there is an abnormal termination the memory 
  22. remains allocated.  Depending on how much expanded memory you have available, 
  23. you may have to reboot to free this memory.  When you exit ATOMS, the error 
  24. code is printed out: if the error code is other than zero, the memory may not 
  25. have been deallocated.
  26.  
  27. An expanded memory driver for 80386 computers with Phoenix BIOS is included in 
  28. a separate subdirectory, /EMM, on this disk (700K or 1.2M disk) or on disk 2 
  29. (360K disks).  To install this driver, run INSTQMM.  It may or may not run 
  30. with other hardware.
  31.  
  32. This release of ATOMS uses 498,097 bytes of RAM.  It allows 2400 total 
  33. displayed atoms and 2800 total displayed bonds.  The maximum number of input 
  34. atoms (symmetrically distinct atoms) is 1200, the number of input bonds or bond 
  35. types is 55, and the number of input polyhedron types is 12.  The number of 
  36. total polyhedra displayed depends on coordination number; you can have about 
  37. 600 tetrahedra, or 300 octahedra, or a correspondingly smaller number of 
  38. larger polyhedra.  ATOMS allows 20 forms and 120 each of faces, edges and 
  39. corners.  
  40.  
  41. The maximum number of atoms is typically reached with boundary faces at 
  42. central distances of about 15 angstroms, depending on structure density; that 
  43. is you can show a volume of about 30 angstroms on edge.
  44.  
  45. The facility for calling for a DIRectory or issuing other DOS commands from 
  46. within ATOMS, e.g. in [B.2], uses the PAUSE command in FORTRAN.  Unfortunately 
  47. the current implementation of this by Microsoft usually suppresses error 
  48. messages if the DOS command fails.  Two known types of failure are: (1) the 
  49. DIR command fails if there is insufficient memory; (2) the code for the 
  50. command requested must be on the current disk and sub-directory, or must be 
  51. accessible through a DOS PATH command.  Thus if DIR or other DOS command gives 
  52. no output, (1) see how much memory you have available with CHKDSK, and remove 
  53. memory-resident programs if necessary; and/or (2) use the PATH command to make 
  54. your DOS routines accessible on your hard disk, or copy any routines needed 
  55. (such as DIR.COM) to the sub-directory or floppy disk you are using.
  56.  
  57. This version of ATOMS uses by default a form of direct or low-level serial 
  58. output for the pen-plotter, if it is on a serial port.  Previous experience 
  59. has shown that using DOS or BIOS serial output is not completely satisfactory.  
  60. It is possible that the low-level output may fail on some machines which are 
  61. not completely IBM compatible.  There is thus an option in the serial port 
  62. input for graphics printer [M.2.2] and pen-plotter [M.3.2] for using direct or 
  63. low-level output (default) or DOS output (although this is superfluous for the 
  64. dot-matrix output, which is always direct).  If you find that the direct 
  65. output fails, the DOS output should work for you.  However, this often leads 
  66. to DOS messages such as "Write fault error...", when the plotter buffer fills 
  67. up.  Pressing "R" for retry will allow you to continue.  You can eliminate 
  68. these hitches by initializing the serial port with the MODE command, 
  69. specifying automatic retry with the p option, e.g.: 
  70.           MODE COM1:96,n,8,1,p
  71. This can be done before running ATOMS (e.g. in the AUTOEXEC.BAT file), or 
  72. through the DIR or DOS-command [B.2] option in ATOMS if you forget.
  73.  
  74. The direct-output option, and the DOS-output option when automatic retry is in 
  75. effect, do not show error messages if the plotter is not connected, is not 
  76. turned on, or there is some other problem.  In the direct-output option, 
  77. CTRL-C will return you to ATOMS; in the DOS-output version, CTRL-C will 
  78. return you to DOS. 
  79.  
  80.  
  81.