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/ NetNews Usenet Archive 1993 #3 / NN_1993_3.iso / spool / bionet / software / 2539 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1993-01-28  |  1.8 KB
  1. Path: sparky!uunet!biosci!s.u-tokyo!news.u-tokyo.ac.jp!wnoc-tyo-news!sh.wide!sun-barr!cs.utexas.edu!swrinde!emory!sol.ctr.columbia.edu!spool.mu.edu!agate!doc.ic.ac.uk!uknet!daresbury!news
  2. From: BIONET@FRCGM51.EARN
  3. Newsgroups: bionet.software
  4. Subject: Re: atomic to phipsi
  5. Message-ID: <1993Jan27.104356.10498@gserv1.dl.ac.uk>
  6. Date: 27 Jan 93 11:41:00 GMT
  7. Sender: list-admin@daresbury.ac.uk
  8.               from FRCGM51.BITNET (BIONET) by UKACRL.BITNET (Mailer R2.07) with
  9.                BSMTP id 1509; Wed, 27 Jan 93 10: 43:04 GMT
  10.            from DECNET-MAIL by FRCGM51.BITNET with PMDF#10000; Wed, 27 Jan 1993
  11. Distribution: bionet
  12. Lines: 27
  13. X-Envelope-To: bio-software@daresbury.ac.uk
  14. Original-To: bio-software@UK.AC.DARESBURY
  15. X-Vms-To: in%"bio-software@daresbury.ac.uk"
  16.  
  17.  
  18.  
  19.  
  20. >
  21. > Hi all.  This is a really dumb question, but for the life
  22. > of me I cannot find a routine for converting atomic
  23. > coordinates to phi-psi angles.  Basically, I would like
  24. > something that will accept Brookhaven type coordinates and
  25. > convert them.  Better yet,  maybe Brookhaven has phi-psi
  26. > angles already generated.  I don't know.  If you are familiar
  27. > with this, or know where routines like this exist, I would
  28. > be very grateful.
  29. > Thank you,
  30. > George Johnson
  31.  
  32.         Each PDB release is distributed with a set of ancillary programs.
  33.  One of them is DIHDRL: "complete torsion angles" and another one is FISIPL:
  34.  "PHI/PSI plots on printer". They are written in plain old FORTRAN and,
  35.  therefore, are easily modifiable to meet your particular requirements.
  36.  
  37.         Good luck,
  38.  
  39.    ------------------------------------------------------------
  40.    |  Jean-Loup Risler                |                        |
  41.    | Centre de Genetique Moleculaire  |  risler@frcgm51.bitnet |
  42.    | 91190  Gif sur Yvette  France    |                        |
  43.    -------------------------------------------------------------
  44.