home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1993 #3 / NN_1993_3.iso / spool / bionet / software / 2538 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1993-01-27  |  1.2 KB
  1. Path: sparky!uunet!news.univie.ac.at!scsing.switch.ch!univ-lyon1.fr!ghost.dsi.unimi.it!rpi!uwm.edu!biosci!daresbury!buzz.bmc.uu.se!embl-heidelberg.de!rainer-mac.embl-heidelberg.de!user
  2. From: Fuchs@EMBL-Heidelberg.DE (Rainer Fuchs)
  3. Newsgroups: bionet.software
  4. Subject: BLOCKS searches on VAX/VMS and Alpha/OpenVMS
  5. Message-ID: <Fuchs-270193150431@rainer-mac.embl-heidelberg.de>
  6. Date: 27 Jan 93 14:08:05 GMT
  7. Followup-To: bionet.software
  8. Organization: EMBL Data Library
  9. Lines: 16
  10. Nntp-Posting-Host: rainer-mac.embl-heidelberg.de
  11.  
  12. A new program, BlockSearch, is available for the analysis of new protein
  13. sequences using site-specific scoring matrices derived from Steven and
  14. Jorja Henikoff's BLOCKS database. The program was developed primarily for
  15. VMS/OpenVMS systems, but is written in ANSI C and should work on other
  16. platforms as well. It reads sequences in a variety of formats, including
  17. SWISS-PROT and GCG. A comparison of a typical-length protein sequence
  18. against BLOCKS release 6 takes about 15-20 CPU secs.
  19.  
  20. A copy can be obtained from ftp.embl-heidelberg.de
  21. (/pub/software/vax/blksrch.uue) or by email from netserv@embl-heidelberg.de
  22. (get vax_software:blksrch.uue).
  23.  
  24.  
  25. Rainer Fuchs
  26. EMBL Data Library
  27. Fuchs@EMBL-Heidelberg.DE
  28.