home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1993 #3 / NN_1993_3.iso / spool / bionet / software / 2492 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1993-01-21  |  1.9 KB  |  65 lines
  1. Newsgroups: bionet.software
  2. Path: sparky!uunet!noc.near.net!news.cs.brandeis.edu!news
  3. From: Jeremy John Ahouse <ahouse@hydra.rose.brandeis.edu>
  4. Subject: Re: ClustalV in SeqApp
  5. Message-ID: <1993Jan21.200053.5626@news.cs.brandeis.edu>
  6. X-Xxdate: Thu, 21 Jan 93 20: 04:17 GMT
  7. Sender: news@news.cs.brandeis.edu (USENET News System)
  8. Organization: Center for Complex Systems
  9. X-Useragent: Nuntius v1.1.1d17
  10. References: <1993Jan19.221442.22635@news.cs.brandeis.edu>
  11. Date: Thu, 21 Jan 1993 20:00:53 GMT
  12. Lines: 51
  13.  
  14. In article <1993Jan19.221442.22635@news.cs.brandeis.edu> Jeremy John
  15. Ahouse, ahouse@hydra.rose.brandeis.edu writes:
  16.  
  17. >OK, I have tried using ClustalV from SeqApp again.  I redownloaded
  18. >the files.   The loaded the sample file, selected some of the aa's
  19. >and then chose the mult alignment option.  At this point, as it was
  20. >the last time, my whole system hung and I dropped into the debugger
  21. >with no way out, except to reboot. > >    Does this work smoothly
  22. for everyone else?
  23.  
  24. A couple of responses, here and by email, encouraged me to look to
  25. system extensions, after a morning of removing them all and then
  26. adding them back one at a time found that superClock 3.9 (or 4.0.1 as
  27. it turns out) are involved in my system crash...  
  28.  
  29. I would be interested to hear if this is a common finding.  I really
  30. like this particular extension and am sad to see it go, but just now
  31. multiple alignment is more important.
  32.  
  33.     by the way the following extensions do not(!) seem to cause 
  34. problems:
  35.  
  36. !Extensions Manager
  37. !Rival 1.1.9
  38. After Dark
  39. After Dark Files
  40. AppleCD Speed Switch
  41. Color
  42. File Sharing Monitor
  43. General Controls
  44. HAM
  45. HDT LightShow! 1.0
  46. HDT Prober! 1.0
  47. Keyboard
  48. Labels
  49. MacTCP 1.1
  50. Map
  51. Memory
  52. Monitors
  53. Mouse
  54. Network
  55. Serial Switch
  56. Sharing Setup
  57.  
  58.             Jeremy John Ahouse
  59.             Center for Complex Systems and Biology Dept
  60.             Brandeis University
  61.             Waltham, MA 02254-9110
  62.  
  63.             (617) 736-4954
  64.             email: ahouse@hydra.rose.brandeis.edu
  65.