home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1992 #27 / NN_1992_27.iso / spool / bionet / software / 2129 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1992-11-18  |  1.6 KB
  1. Path: sparky!uunet!stanford.edu!agate!doc.ic.ac.uk!daresbury!embnet.se!embl-heidelberg.de!rice
  2. From: rice@embl-heidelberg.de (Peter Rice)
  3. Newsgroups: bionet.software
  4. Subject: Re: New RNAfold for VAX?
  5. Message-ID: <1992Nov18.170313.50696@embl-heidelberg.de>
  6. Date: 18 Nov 92 17:03:13 +0100
  7. References: <zxmkr08.722024950@studserv>
  8. Organization: EMBL, European Molecular Biology Laboratory
  9. Lines: 22
  10.  
  11. In article <zxmkr08.722024950@studserv>, zxmkr08@studserv.zdv.uni-tuebingen.de (Cornelius Krasel) writes:
  12. > Hello BioNetters,
  13. > 
  14. > I am looking for an executable or Fortran source for Zuker's new RNAfold
  15. > which is able to do suboptimal folding, for a VAXstation 4000/60.
  16. > I AM aware that there is a version for Macs out there, but it is
  17. > limited to 200 (?) bases (and, in addition, our VAX has more
  18. > computing power :-). I didn't find it at the Embl (my list is from the
  19. > 14th of Nov.), and I was  unsuccessful with Archie.
  20.  
  21. The latest release of GCG (7.2) has Zuker's suboptimal fold program, under
  22. the name MFOLD, among the new programs.
  23.  
  24.  -----------------------------------------------------------------------------
  25.  Peter Rice, EMBL                             | Post: Computer Group
  26.                                               |       European Molecular
  27.  Internet:    Peter.Rice@EMBL-Heidelberg.DE   |            Biology Laboratory
  28.                                               |       Postfach 10-2209
  29.  Phone:   +49-6221-387247                     |       W-6900 Heidelberg
  30.  Fax:     +49-6221-387306                     |       Germany
  31.  
  32.  ... and occasionally price@crc.ac.uk ...
  33.