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Encoding:
Text File  |  1991-07-31  |  3.7 KB  |  81 lines
  1. ========================================================================
  2.                            RELEASE NOTES
  3. ========================================================================
  4.  
  5.  
  6. Release notes for version 1.01,  released 4-16-91
  7.  
  8.  1. A warning dialog box is presented when deleting a sequence from the
  9.     alignment using the Cut or Clear commands.  It is easy to do this 
  10.     accidently by just pressing the delete key, so it is nice to have
  11.     a way to back out of the operation.
  12.  
  13.  2. While making change (1), I discovered a bug in the Copy command,
  14.     which caused the program to bomb the _second_ time a sequence was
  15.     Copied to the clipboard.
  16.  
  17.  3. MACAW now makes use of more memory when performing a search.  
  18.     Previously, the hit array and the diagonal array were each limited 
  19.     to 64K (128K total).  Consequently, it was common to run out of 
  20.     memory when searching over many long sequences, even on systems with
  21.     16 M of RAM. 
  22.  
  23.  4. There was a bug that caused unpredictable behavior when sending 
  24.     output to a plotter (It had to do with the use of a particular 
  25.     drawing command that was not supported for plotters).  This came up
  26.     in the context of capturing HPGL plotter commands in a file and 
  27.     importing the file into CorelDraw, PageMaker, and so forth.
  28.     After fixing the simple bug, this seems to work correctly.  You need
  29.     to add a line to the [ports] section of your win.ini file to set up
  30.     a filename as a 'printer port', then install an HP plotter driver
  31.     conneted to that filename.  MACAW output is then sent to the file
  32.     and imported into Corel Draw. 
  33.  
  34.  5. Many users reported confusion at the "(number x)" label that was
  35.     automatically assigned to blocks, so blocks are now left without
  36.     a label when initially created.  You can assign a label in the 
  37.     BlockEditor, but it is not required.
  38.  
  39.  6. The Autokeep option now only keeps blocks when they are linked.  This
  40.     reduces the accumulation of too many useless blocks.
  41.  
  42.  
  43.  
  44. Release notes for version 1.02,  released 5-10-91
  45.  
  46.  1. When printing the blocks, the value of m reported was wrong.  This 
  47.     bug has been fixed. 
  48.  
  49.  2. The Export function allowed the user to specify a line length, but
  50.     then ignored the value and used a line length of 50 instead.  
  51.     Version 1.02 handles line length correctly.
  52.  
  53.  
  54.  
  55. Release notes for version 1.03,  released 8-01-91
  56.  
  57.  1. ** NOTE **  There has been a slight modification of the file format
  58.     for MACAW data files (*.MCW).  Although it _should_ be transparent,
  59.     it may be wise to make backup copies of all of your data files before
  60.     using the new version.
  61.  
  62.  2. In previous versions of the program, there was a bug which resulted
  63.     in an inability to read certain MCW files in which any of the user-
  64.     editable text fields (e.g. sequence description) contained the 
  65.     double quote character.  Version 1.03 translates all double quotes
  66.     to the single quote character to avoid this problem.
  67.  
  68.  3. A new file type "RNA" has been added to the File Open dialog box.
  69.     In addition, there is a new score file "iupac.scr" which includes
  70.     'U' as a valid sequence character (treated exactly like a 'T') as
  71.     well as all of the IUB-IUPAC ambiguity codes. This should be used
  72.     as a replacement for the old "DNAxxx.scr" files, which only accepted
  73.     'G', 'A', 'T', and 'C'.  DNA and RNA sequences may be mixed in a
  74.     single alignment.
  75.  
  76.  4. The "Search Results" was previously a modal dialog box, meaning that
  77.     the windows behind it were inactivated until the dialog was dismissed
  78.     by pressing the "Done" button.  It is now modeless, so it is possible
  79.     to go back to the schematic or alignment windows while the window is
  80.     open.
  81.