home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1993 #3 / NN_1993_3.iso / spool / talk / origins / 16816 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1993-01-28  |  4.3 KB
  1. Path: sparky!uunet!ulowell!m2c!bu.edu!bu-bio!colby
  2. From: colby@bu-bio.bu.edu (Chris Colby)
  3. Newsgroups: talk.origins
  4. Subject: in defense of directed mutagenesis
  5. Message-ID: <108337@bu.edu>
  6. Date: 26 Jan 93 20:55:27 GMT
  7. References: <1jelm6$ejh@agate.berkeley.edu> <1785@tdat.teradata.COM>
  8. Sender: news@bu.edu
  9. Organization: animal -- coelomate -- deuterostome
  10. Lines: 80
  11.  
  12. In article <1785@tdat.teradata.COM> swf@tools3teradata.com (Stan Friesen) writes:
  13.  
  14. [much good stuff, not surprizing since it came from Stan, deleted]
  15.  
  16. >As for the directed mutations in bacteria - if that is indeed shown to be a
  17. >general mechanism of change it *would* cause the rejection of the Darwinian
  18. >model in favor of a new form of orthogenesis.
  19.  
  20. A quibble: The Darwinian model would be appended, not rejected, if 
  21. directed mutagenesis were to become accepted. Random mutations still
  22. occur, and if they result in a new allele with a different fitness than
  23. the other alleles at the locus in question, natural selection will
  24. occur. The big question, of course, is what is the relative contribution of
  25. the two types of adaptive mechanisms (selection and directed
  26. mutagenesis)?
  27.  
  28. >But so far it has shown up only in one series of experiments, in one group
  29. >of bacteria, under very odd circumstances.  The effect is not even particularly
  30. >strong - it is barely detectable statistically - which makes it questionable.
  31.  
  32. Uh... no. It has been shown in _E. Coli_ and _Salmonella typhimurium_ (two
  33. prokaryotes) and _Saccharomyces cerevisae_ (yeast - a eukaryote). Point
  34. mutations, double point mutations and frameshift mutations have all been
  35. shown to revert to "wild type" at a much higher frequency in the
  36. presence of the selective agent than in its absence. Mutation rates
  37. at other loci have been unaffected (i.e. presense of the selective agent
  38. is not a general mutagen). The effects are not small, in one of Hall's
  39. study the mutation rate was 10^8 fold higher than expected under a
  40. random model. Being statistically detectable wasn't a problem.
  41.  
  42. >*If* it is ever confirmed more strongly, *and* is shown to be much more widely
  43. >occuring than is now suggested, it will be time to revise our theories of
  44. >evolution.
  45.  
  46. IMHO, it is now time to revise our theories of evolution with respect to
  47. single celled organisms (or organisms with totipotent cell lines --
  48. two examples would be plants and sponges). I don't think directed
  49. mutagenesis will work in multicellular organisms with a separate germ
  50. line (again, discounting those with totipotent cell lines), and I
  51. think the opportunity for it to act may be limited. There's no data yet 
  52. on the full range of circumstances directed mutagenesis can occur in.
  53. For example, can dir. mut. do more than fix "broken genes"? -- Can
  54. it come up with novel adaptive solutions to environmental "problems"?
  55. I'm willing to bet yes given the distribution of types of reversion
  56. mutants seen in the dir. mut. studies; both true revertants and
  57. suppresor mutations show up.
  58.  
  59. It will certainly be interesting to see what the mechanism of
  60. directed mutation (actually, it is mainly going by the name
  61. adaptive mutagenesis these days) is.
  62.  
  63. One of the last couple issues of _Science_ had a review article
  64. critical of directed mutagenesis (Lenski and Mittler, 1993, The
  65. Directed Mutation Controversy and Neo-Darwinism, Science 259: 188-
  66. 193). An interesting article (although I'm convinced adaptive
  67. mutations occur) and, if you are unfamiliar with the controversy,
  68. a complete list of the relevant citations. 
  69.  
  70. On Monday
  71. I'm going to hear a seminar by Pat Foster (who formerly worked with
  72. Cairns) titled something like "The mechanism of adaptive mutation".
  73. If she has found it, I'll relay the news here. However, she was
  74. an author on a recent _Genetics_ paper with roughly the same title and
  75. all they did was rule out some of the proposed mechanisms. (I hope it
  76. isn't Hall's "hypermutable state" model, I bet Larry Moran 10 bucks
  77. that it wasn't 8-)
  78.  
  79. Stan,
  80. Sorry to jump all over your post, but I really think adaptive
  81. mutation is a potentially important mechanism of evolution.
  82. Time will tell.
  83.  
  84. >sarima@teradata.com            (formerly tdatirv!sarima)
  85. >  or
  86. >Stanley.Friesen@ElSegundoCA.ncr.com
  87.  
  88. Chris Colby     ---     email: colby@bu-bio.bu.edu    ---
  89. "'My boy,' he said, 'you are descended from a long line of determined,
  90. resourceful, microscopic tadpoles--champions every one.'"
  91.      --Kurt Vonnegut from "Galapagos"
  92.