home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1993 #3 / NN_1993_3.iso / spool / bionet / software / 2536 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1993-01-27  |  1.3 KB  |  28 lines
  1. Newsgroups: bionet.software
  2. Path: sparky!uunet!news.univie.ac.at!scsing.switch.ch!univ-lyon1.fr!ghost.dsi.unimi.it!rpi!utcsri!newsflash.concordia.ca!mizar.cc.umanitoba.ca!access.usask.ca!kakwa.ucs.ualberta.ca!news
  3. From: rndy@wimsey.mmid.ualberta.ca (Randy Read)
  4. Subject: PIMA on SGI
  5. Message-ID: <1993Jan27.081224.21491@kakwa.ucs.ualberta.ca>
  6. Keywords: protein sequence alignment
  7. Sender: news@kakwa.ucs.ualberta.ca
  8. Nntp-Posting-Host: wimsey.mmid.ualberta.ca
  9. Reply-To: rndy@wimsey.mmid.ualberta.ca 
  10. Organization: University Of Alberta, Edmonton Canada
  11. Date: Wed, 27 Jan 1993 08:12:24 GMT
  12. Lines: 14
  13.  
  14. I've downloaded Smith & Smith's PIMA (Pattern Induced Multiple Alignment)  
  15. package (MBCRR-Package/pima-1.22.tar.Z on mbcrr.harvard.edu) by ftp as  
  16. suggested in their paper.  Attempts to install the package on either an SGI or  
  17. a NeXT lead to a number of compile-time warnings and fatal errors.  I still  
  18. only speak pidgin C, so I'm hoping that someone with a greater facility with  
  19. the language has sorted this out.
  20.  
  21. Has anyone out there succeeded in implementing this package on SGI hardware?   
  22. If so, is the revised version available, or is it just a matter of the right  
  23. compiler flags?  I would greatly appreciate any information, either by e-mail  
  24. or posted to this newsgroup.
  25.  
  26. Randy J. Read
  27. rndy@wimsey.mmid.ualberta.ca
  28.