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/ NetNews Usenet Archive 1992 #31 / NN_1992_31.iso / spool / bionet / software / 2347 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1993-01-01  |  3.4 KB
  1. Path: sparky!uunet!pipex!bnr.co.uk!uknet!mcsun!Germany.EU.net!rrz.uni-koeln.de!rrz.uni-koeln.de!biomed.biolan.uni-koeln.de!KHOFMANN
  2. From: khofmann@biomed.biolan.uni-koeln.de
  3. Newsgroups: bionet.software
  4. Subject: Re: question on the prograph
  5. Message-ID: <1993Jan01.181932.150651@rrz.uni-koeln.de>
  6. Date: 1 Jan 93 18:19:32 GMT
  7. References: <00965EF6.D6E9A300.13533@TIGGER.STCLOUD.MSUS.EDU>
  8. Sender: news@rrz.uni-koeln.de (Usenet News System)
  9. Reply-To: khofmann@biomed.biolan.uni-koeln.de
  10. Distribution: bionet
  11. Organization: Biochemical Institute, Cologne University
  12. Lines: 55
  13.  
  14. In article <00965EF6.D6E9A300.13533@TIGGER.STCLOUD.MSUS.EDU>, q00023@TIGGER.STCLOUD.MSUS.EDU writes:
  15. >Dear netters,
  16. >    I need to know how to use the prograph.zip program and the main use of
  17. >the program. I already unzip the program, but I don't know how to use the
  18. >program. Could anyone tell me more of the details of the program.
  19. >
  20. >THANKS IN ADVANCE,
  21. >Gabriel Cheung
  22. >
  23.  
  24. PROFILEGRAPH is, as far as i understand (and i am supposed to do so), a program
  25. that tries to help you with the analysis of protein sequences.
  26. You certainly know hydrophobicity profiles or and hydrophobic moment plots.
  27. The current version of PROGRAPH (2.3a) can do such plots and a lot of related
  28. ones using various parameters and parameter combinations. It also includes
  29. some auxiliary functions (helical wheel diagrams etc.). Most important,
  30. PROGRAPH works completely in graphics mode and has a menu-driven shell,
  31. assuming that you know what you are doing on the protein analysis side 
  32. but not necessarily on the computer application side :-)
  33.  
  34. Whe unzipped, it comes with various configuration files (*.cfg) for monitors
  35. with different resolutions. The one configuration file, used by default,
  36. is called PROGRAPH.CFG and is (intentionally) missing in the .ZIP file.
  37. it is created when first running the program (prograph.exe) if you choose
  38. the menu-item "save preferences". If you want to run the program with one
  39. of the prefabricated CFG-files type something like "PROGRAPH PG256.CFG"
  40. when invoking the program. There is only one question that needs to be 
  41. answered to start the program: The location of the BGI graphics drivers.
  42. If you don't store them at a special place, use the directory that holds the
  43. PROGRAPH files as an answer, the BGI drivers cam bundled with the program.
  44.  
  45. By the way, the main ZIP file PROGRAPH.ZIP contains 3 further ZIP files
  46. PG_EXE.ZIP, PG_SRC.ZIP and PG_DOC.ZIP
  47. in order to run the program, you need only PG_EXE.ZIP 
  48. Forget about the other two, except you like to read the documentation :-)
  49. The documentation (in ASCII, Winword and Postscript format) tells you most
  50. other things you need to run the program.
  51.  
  52. If you have further question, don't hesitate to contact me, you find my adress
  53. in the signature below.
  54.  
  55. P.S. Profilegraph 3.0 will be coming within the next months and it will
  56. include some nice new features and bugs, but i wouldn't hold my breath..
  57.  
  58. A happy new year,
  59.                   Kay
  60.  
  61. -------------------------------------------------------------------------------
  62. Kay O. Hofmann     7                       Tel.: +49 221 478-6980
  63. Institut fuer Biochemie (med. Fak.)       Fax.: +49 221 478-6979
  64. Universitaet Koeln
  65. Joseph Stelzmann Str. 52          Internet: khofmann@biomed.biolan.uni-koeln.de
  66. D-5000 Koeln 41                             khofmann@gen1.genetik.uni-koeln.de
  67. Germany
  68. -------------------------------------------------------------------------------
  69.