home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1992 #31 / NN_1992_31.iso / spool / bionet / general / 1997 < prev    next >
Encoding:
Internet Message Format  |  1992-12-21  |  6.2 KB
  1. Path: sparky!uunet!pipex!bnr.co.uk!uknet!daresbury!news
  2. From: I.Bowes@southampton.ac.uk ("I.Bowes")
  3. Newsgroups: bionet.general
  4. Subject: The Legume Database ILDIS
  5. Message-ID: <1992Dec21.173339.3270@gserv1.dl.ac.uk>
  6. Date: 21 Dec 92 17:31:36 GMT
  7. Sender: list-admin@daresbury.ac.uk
  8. Distribution: bionet
  9. Lines: 162
  10. Original-To: bioforum@uk.ac.daresbury
  11. X-Mailer: ELM [version 2.3 PL11]
  12.  
  13.  
  14.  
  15. Dear All,
  16.    Since we were mentioned by Brian Foley, I thought I'd post a little 
  17. info on us, here at ILDIS in Southampton, U.K.
  18.  
  19.  
  20. [LONG: 880 words]
  21.  
  22. /*----------------------------------------------------------*/
  23.  
  24.               ILDIS CO-ORDINATING CENTRE
  25.                  F.A. Bisby,  S. Hollis
  26.                    Biology Department,
  27.                University of Southampton,
  28.                 SOUTHAMPTON SO9 3TU, U.K.
  29.  
  30.  
  31. ILDIS is an international project to describe and catalogue
  32. the world's legume species diversity in a readily accessible
  33. form.  Research groups in many countries are participating
  34. on a co-operative basis to pool information in a database.
  35. This database is used to provide a worldwide species
  36. diversity information service by publications, electronic
  37. services and enquiry services.
  38.  
  39. The long term aims of the ILDIS project are to provide:
  40.  
  41. 1.  a source of information for the development of all
  42. useful legume crops and legume products, especially in the
  43. arid zones and humid tropics;
  44.  
  45. 2.  a focus for the study and conservation of legumes.
  46.  
  47. ILDIS is directed by an International Board of Trustees
  48. elected by the participating centres. It is a not-for-profit
  49. organisation registered as a charitable trust under English
  50. Law.
  51.  
  52. ILDIS is committed to providing a flexible and easy to use
  53. information service on Legumes to a wide range of
  54. environmental, botanical, pharmaceutical, agricultural and
  55. regulatory disciplines including plant exploitation,
  56. biotechnology, biodiversity and conservation.
  57.  
  58. Electronic services will include distribution of the data
  59. sets for in-house use (available from the Co-ordinating
  60. Centre), on-line access (late 1992), and in the future,
  61. distribution of the database with software on disc.
  62.  
  63. A variety of publications are planned, including regional
  64. check-lists and compendia.  Check-lists have already been
  65. published for Africa (1989) and West Asia (1991).  Two
  66. compendia; "Legumes of the World" and "Phytochemical
  67. Dictionary of the Leguminosae" are in preparation.
  68.  
  69. Reports tailored to users' specifications and factual
  70. enquiries and searches are available through the Co-
  71. ordinating Centre and regional contact points.
  72.  
  73. ILDIS INFORMATION SYSTEM:
  74. PHASE 1  DATABASE
  75.  
  76. Phase 1 of the database comprises a synonymised species
  77. check-list and the geographical distribution, common
  78. knowledge data, and references to the bibliography for each
  79. species. The data fields are listed below.  The data set is
  80. being compiled on a regional basis and then co-ordinated for
  81. taxonomic integrity by legume taxonomists using the ALICE
  82. software. Work is now proceeding to provide data on legumes
  83. from the remaining continents.  When complete, approximately
  84. 18000 species, one twelfth of the world's flowering plants
  85. will be included.
  86.  
  87. The Phase 1 database contains the following information
  88. which will be completed for each species, and in many cases
  89. for each subspecies or botanical variety:
  90.  
  91. CHECK-LIST DATA
  92. 1.  Accepted name, authority and references
  93. 2.  Synonyms, authorities and references
  94. 3.  Legume tribe or subtribe membership
  95.  
  96. GEOGRAPHICAL DISTRIBUTION
  97. 4.  a)  Occurrence by continent
  98.     b)  Occurrence by country
  99.     c)  Occurrence by area (certain countries only)
  100.     d)  Status in each country and references
  101.  
  102. COMMON KNOWLEDGE DATA
  103. 5.  Vernacular names with references (certain languages only)
  104. 6.  Vegetation type with reference
  105. 7.  Life form:         a)  whether annual and/or perennial
  106.                        b)  whether herb,shrub or tree
  107.                        c)  whether climbing or not
  108. 8.  Conservation status with references
  109. 9.  Economic importance and uses with references
  110. 10. Notes about the taxon
  111. 11. References to published descriptions
  112. 12. References to published illustrations
  113. 13. References to published distribution maps
  114.  
  115. ILDIS INFORMATION SYSTEM:
  116. PHASE 2  DATABASE
  117.  
  118. >From the start of ILDIS in 1985, the Phase 1 species
  119. reference system was intended to be the backbone of a Phase
  120. 2 species diversity information system which would include
  121. data relevant to applied botany organised by species.  The
  122. Phase 2 system will incorporate data "modules" on such
  123. topics as phytochemical records for secondary substances,
  124. germplasm and seed sources, nodulation, breeding and
  125. biotechnology, cytology and plant uses.  The system will
  126. function as a well-organised source of species diversity
  127. data about legume species.
  128.  
  129.  
  130. Phase 2 modules in preparation
  131. PHYTOCHEMISTRY.  Comprehensive records of the substances,
  132. the organs in which they are recorded and the species in
  133. which they are found are being compiled as a joint project
  134. involving Chapman & Hall Scientific Data Division (C & H)
  135. and ILDIS.  The ILDIS Phase 1 database and the C & H
  136. chemical database are used to link phytochemical records
  137. occuring under several plant synonyms and records of the
  138. same substance under alternative chemical names.  The module
  139. is being used to create a hardcopy "Phytochemical Dictionary
  140. of the Leguminosae"  published by C & H, and as part of the
  141. electronic information services of ILDIS.  The data is held
  142. in a linked dataset under the CHILDISC software.
  143.  
  144. Project Chairman: J.B. Harborne, University of Reading
  145.  
  146. Chapman & Hall Scientific Data Division, London;
  147. J. Buckingham, I. Southon
  148.  
  149. ILDIS, Southampton; F.A. Bisby, R.J. White, I. Bowes
  150.  
  151. Example:
  152.            Leucinine, an amino acid occurring
  153.            in Mimosa pudica L. and
  154.            Leucaena leucocephala (Lam.) De Wit.
  155.  
  156. NODULATION.  So far records have been collated to show which
  157. species are recorded as nodulating, not nodulating or both,
  158. using the ILDIS Phase 1 database and ALICE software.
  159.  
  160. Project organiser: J.H. Kirkbride, USDA, Beltsville
  161.  
  162. /*-------------------------------------------------------*/
  163.  
  164. We provide an information service on legumes and if anyone
  165. wants to ask our help, they are welcome to do so. Any
  166. comments or queries eMail this list or
  167.  
  168. s.hollis@uk.ac.southampton,
  169. j.a.tree@uk.ac.southampton, or
  170. i.bowes@uk.ac.southampton (phytochemistry project)
  171.  
  172. Cheers
  173.  
  174. Ian Bowes.
  175.