home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ NetNews Usenet Archive 1992 #27 / NN_1992_27.iso / spool / bionet / software / 2154 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1992-11-23  |  1.1 KB  |  28 lines
  1. Newsgroups: bionet.software
  2. Path: sparky!uunet!zaphod.mps.ohio-state.edu!sol.ctr.columbia.edu!ira.uka.de!math.fu-berlin.de!unidui!rrz.uni-koeln.de!rrz.uni-koeln.de!biomed.biolan.uni-koeln.de!KHOFMANN
  3. From: khofmann@biomed.biolan.uni-koeln.de
  4. Subject: Re: Program for alignment with "boxes" ?
  5. Message-ID: <1992Nov23.104224.102256@rrz.uni-koeln.de>
  6. Sender: news@rrz.uni-koeln.de (Usenet News System)
  7. Reply-To: khofmann@biomed.biolan.uni-koeln.de
  8. Organization: Biochemical Institute, Cologne University
  9. References: <1992Nov21.120846.17648@gserv1.dl.ac.uk>
  10. Distribution: bionet
  11. Date: Mon, 23 Nov 92 10:42:24 GMT
  12. Lines: 14
  13.  
  14. In article <1992Nov21.120846.17648@gserv1.dl.ac.uk>, Roman.Jerala@IJS.si writes:
  15. >Hallo netters, 
  16. >does anybody know of a program which, when given as input alignment of several 
  17. >sequences, adds boxes around aminoacids when more than ?% are equal (as you can
  18. >often see in publcations). I would prefer version for PC or SGI and ftp-able 
  19. >programs.
  20.  
  21. You could try BOXSHADE. It is available by FTP from
  22. BIOMED.BIOLAN.UNI-KOELN.DE and a couple of other ftp-servers.
  23. There are versions for VAX/VMS and for MSDOS.
  24.  
  25. Best Regards,
  26.                Kay
  27.  
  28.