Κεντρικό στοιχείο της φιλοσοφίας οργάνωσης του Ωνασείου Καρδιοχειρουργικού Κέντρου αποτέλεσε η εξασφάλιση της άψογης λειτουργίας και ετοιμότητας των υπηρεσιών. Ετσι, η Διοίκηση του Κέντρου επεξεργάστηκε κατάλληλο πλέγμα κανονισμών και διαδικασιών οι οποίες ακολουθούνται κατά γράμμα από ολόκληρο το προσωπικό και σε κάθε περιστατικό. Ενδεικτικά αναφέρουμε ότι το ΩΚΚ είναι το πρώτο ελληνικό νοσοκομείο που δημιούργησε Γραφείο Διασφάλισης Ποιότητας για τον καθημερινό έλεγχο αλλά και την περαιτέρω βελτίωση της ποιότητας των υπηρεσιών που προσφέρει.

Κεντρικό στοιχείο της φιλοσοφίας του ΩΚΚ αποτελεί επίσης η θεμελίωση ενός σύγχρονου ιατρικού πολιτισμού και στην Ελλάδα. Αυτό βέβαια είναι ένα όραμα που απαιτεί καθημερινές προσπάθειες, έχοντας πάντα ως επίκεντρο τον ασθενή στον οποίο πρέπει να παρέχονται οι πιο σύγχρονες και αποτελεσματικές υπηρεσίες με τη στοργή και τη φροντίδα που του αναλογεί.