Στο Ωνάσειο Καρδιοχειρουργικό Κέντρο υπάρχουν
τρεις ισότιμες αυτοτελείς υπηρεσίες: Ιατρική, Νοσηλευτική και Διοικητική
| Γενικός Διευθυντής: | Θεμιστοκλής Χαραμής |
| Διευθυντής Ιατρικής Υπηρεσίας | Αλκιβιάδης Μιχάλης |
| Διευθύντρια Νοσηλευτικής Υπηρεσίας | Αγγελική Σηφάκη - Βασιλάκη |
| Διευθυντής Διοικητικής Υπηρεσίας | Κωνσταντίνος Στεργιόπουλος |
Οι Υπηρεσίες αυτές απαρτίζονται από Τμήματα, Μονάδες και Γραφεία τα οποία στο σύνολο τους διοικούνται από τον αντίστοιχο Διευθυντή.
