Η αποστολή του Ωνασείου Καρδιοχειρουργικού Κέντρου συνοψίζεται στα ακόλουθα:

• Να παρέχει εξειδικευμένες ιατρικές και νοσηλευτικές υπηρεσίες ποιότητας σε άτομα με καρδιαγγειακές παθήσεις.
• Να παρέχει εκπαίδευση:
  • σε γιατρούς και νοσηλευτές στις καρδιοθωρακικές επεμβάσεις.
  • σε γιατρούς και άλλους επιστήμονες στην καρδιοθωρακική έρευνα.
  • στο διοικητικό προσωπικό του για θέματα οργάνωσης, διοίκησης και λειτουργίας νοσοκομείων.
• Να διεξάγει έρευνα σχετική με:
  • την πρόληψη, τον έλεγχο, τη διάγνωση και την αντιμετώπιση των καρδιαγγειακών νοσημάτων
  • τη σημασία της διατροφής και του εναλλακτικού τρόπου ζωής στην πρόληψη των νοσημάτων αυτών
  • τη βιολογία και την αιτιολογία των καρδιαγγειακών παθήσεων
  • τις νέες τεχνικές στους τομείς της καρδιοχειρουργικής, της επεμβατικής καρδιολογίας, των μεταμοσχεύσεων και του ελέγχου της ανοσοκατασταλτικής θεραπείας