Program Pantheon '98 je vybaven nejmodernějším systémem on-line nápovědy, který se shoduje s uživatelskou příručkou. Během práce se systémem můžete kdykoli pomocí klávesy <F1> vyvolat tzv. "kontextovou nápovědu" pro právě aktivní okno a činnosti s ním spojené. Navigaci a vyhledávání v on-line nápovědě vám usnadní funkce nápovědy Obsah, Rejstřík, Vyhledávání. Vybranou stránku nebo kapitolu nápovědy také můžete vytisknout.Vyvolat on-line nápovědu lze kromě použití klávesy F1 také z hlavního panelu (položka nabídky "Nápověda"), případně z Nabídky Start.
Také u většiny tlačítek v panelech nástrojů se objevuje stručná (bublinová) nápověda blíže vysvětlující funkci konkrétního tlačítka. Necháte-li několik sekund ukazatel myši v klidu na libovolném tlačítku panelu nástrojů, tato nápověda bude zobrazena.