V záložce nastavení můžete můžete ovlivnit strategii detekce virové infiltrace a dalšího chování modulu NOD32.

Objekty diagnostiky - umožňuje nastavit, které typy objektů má modul NOD32 testovat.
Metody diagnostiky – umožňuje označit, které metody má modul NOD32 využívat. Doporučuje se využít obě metody.
Citlivost heuristiky – umožňuje nastavit citlivost heuristického algoritmu. Doporučuje se hodnota Standardní. Při hloubkové heuristice dochází ke zvýšení pravděpodobnosti falešného poplachu.

Vypisovat všechny soubory - v případě zatržení tohoto pole budou do protokolu zapisovány všechny testované soubory. Tato možnost výrazně zvyšuje velikost protokolu na disku, lze ji proto doporučit jen ve výjimečných případech. Pokud je pole neaktivní, do protokolu se zapisují pouze soubory, u kterých došlo k závažné události (zavirovaný soubor nebo chyba při testování daného souboru).
Zvukový signál - v případě, že je toto pole zaškrtnuto, při nalezení viru bude vydán zvukový signál.
Používat MAPI rozhraní - umožňuje modulu přistupovat k poštovním souborům, které využívají rozhraní MAPI. Příkladem je MS Outlook nebo MS Exchange.

Protokol povolen - pokud je políčko aktivní, modul NOD32 generuje protokol o diagnostice.
Zarovnání výpisu - pokud je políčko aktivní, příliš dlouhé řádky v protokolu budou zarovnány.
Připojení - výsledky následujícího testu budou připojeny za konec existujícího protokolu.
Přepsání - před následujícím testem dojde k vymazání protokolu.
Maximální délka - zadejte maximální délku protokolu v KB.
Název - zadejte název souboru, do kterého se bude ukládat protokol.
Přípony - zobrazí editor přípon testovaných souborů. Seznam přípon je aktualizován výrobcem a doporučuje se ho měnit.
Rozšířené - zobrazí dialog s rozšířeným nastavením modulu NOD32.

Tlačítka ve spodní části okna (zůstávají shodná):
Diagnostika - spustí testování označených cílů. Okno se přepne na záložku Protokol, ve které se zobrazují průběžné výsledky testování. Během testování se tlačítko Diagnostika změní na Přerušení, kterým lze testování ukončit.
Léčení - spustí testování označených cílů. V případě, že bude během testu nalezen virus, vykoná se akce definovaná v záložce Akce.
Konec – ukončí modul NOD32. V případě, že jste během chodu programu změnili nastavení, objeví se dotaz, zda je chcete uložit do aktuálního profilu.
Nápověda – vyvolá nápovědu programu. Nápovědu můžete vyvolat i stiskem F1.

Nalevo od tlačítek je zobrazena informace o využívané virové databázi (v závorce je datum uveřejnění) a o verzi operačního systému.