Spybot-S&D utiliza el concepto de 'Módulo' para hacerlo más flexible. Cada Módulo es un Fichero que contiene las descipciones de algunos problemas que Spybot-S&D puede detectar y resolver.

Estos ficheros están divididos en categorías, de esta manera puede seleccionar qué problemas quiere resolver mientras dure el análisis.

Las categoría básicas son Spyware y adware, problemas del sistema y Huellas en Uso. Para cada una de estas categorías puede ver sus Módulos correspondientes con una pequeña descripción de lo que hace y el número de archivos, entradas del registro y directorios que serán analizados.

Puede seleccionar cualquier módulo para usarlo en su siguiente análisis marcando la casilla correspondiente a cada uno de ellos.

Si ve un módulo en letra 'Italic' ó 'Itálica', entonces ésta no es original de PepiMK Software. Como el formato de los módulos son públicos, alguien puede escribir un nuevo módulo. Pero estos módulos pueden dañar seriamente su Sistema, y PepiMK Software NO puede GARANTIZARTE el correcto funcionamiento de módulos ajenos a él (no originales), así que deberá preguntarse hasta que punto está realmente seguro de usar un módulo si este no es de PepiMK Software.

Puede encontrar la configuración de los Módulos escogiendo Módulos de la sección Configuración en el Panel de la izquierda.