O KFloppy pode formatar uma disquete de duas maneiras:
Isto apenas põe o novo sistema de ficheiros na disquete. Todos os dados da disquete são apagados. Se a densidade for diferente que a escolhida para a formatação, então os pistas e os sectores da disquete serão realocados antes do sistema de ficheiros estar pronto.
Formata completamente a disquete, realocando os pistas e os sectores, põe o sistema de ficheiros escolhido na disquete, e depois verifica a formatação, marcando os sectores danificados (bad sectors).
As disquetes MS-DOS podem ter uma etiqueta, que pode ser criada escolhendo a opção Etiqueta e escrevendo a etiqueta desejada. As disquetes formatadas em ext2 não podem ter etiquetas.