Univerzitet u Nisu osnovan je 15. juna 1965. godine Zakonom o osnivanju Univerziteta u Nisu.
U pocetku rada u Univerzitet su bila udruzena tri fakulteta: Pravno- ekonomski - sa Pravnim i Ekonomskim odsekom, Medicinski - sa Medicinskim i Stomatoloskim odsekom i Tehnicki - sa Gradjevin-skim, Arhitektonskim, Elektronskim i Masinskim odsekom koji su poceli sa radom 1960. godine, s tim da su do formiranja Univerziteta u Nisu radili u sastavu Univerziteta u Beogradu.
Porast broja studenata, razvoj novih naucnih disciplina i sve izrazenije potrebe privrede i drustvenih delatnosti, vremenom su uslovili reorganizaciju postojecih i osnivanje novih fakul-teta. Tako 1968. godine Elektronski odsek Tehnickog fakulteta prerasta u Elektronski fakultet, a 1970. godine Masinski i Gradjevinski odsek postaju posebni fakulteti. Pravno-ekonomski fakultet je 1971. podeljen na dva posebna fakulteta - Pravni i Ekonomski. Iste godine osnovan je i Filozofski fakultet sa sedam nastavnih grupa: Matematika, Fizika, Hemija, Sociologija, Psihologija, Anglistika i Fizicko vaspitanje. Iz sastava Gradjevinskog fakul-teta se 1972. izdvaja Fakultet zastite na radu. Tehnoloski fakultet u Leskovcu pocinje sa radom 1979. godine. Na Filozofskom fakultetu 1986. prestaje upis studenata na Grupi za psihologiju, a godinu dana kasnije, formira se nova - Studijska grupa za srpski jezik i knjizevnost. Skolske 1993/94. godine pocinje sa radom Uciteljski fakultet u Vranju.